Prokaryot canlılar ile ökaryot canlılar arasındaki temel fark zarlı organellerin bulunmamasıdır. Zarla çevrili çekirdek başta olmak üzere prokaryot hücrelerde hiçbir zarlı organel bulunmaz.

Ribozom organeli iki hücre tipinde de bulunan ortak organeldir. Ancak ribozom organeli zarsız bir organeldir. Bunu unutmamak gerekir. Prokaryot ve ökaryot canlılar yazısında zaten buna değinmiştik.

Prokaryot hücreler ile ökaryot hücreler arasındaki farkları kısaca şöyle özetleyebiliriz:

• Ökaryotlarda çekirdek bulunurken prokaryotlarda yoktur.
• Yine ökaryotlarda zarlı organeller varken prokaryotlarda bulunmaz.
• Ökaryot hücreler hem daha büyüktür hem de daha gelişmiştir.
• Ökaryot hücre yapısında olan canlılar çok hücreli olabilir ancak prokaryotlar tek hücrelidir.
• Ökaryotlarda 2n şeklinde her genden iki tane vardır. Prokatyotlarda bu durum böyle değildir.

Kısaca söylemek gerekirse prokaryot hücreler az gelişmiş ve zarsız yapılar içerir. Bu canlılarda DNA molekülü sitoplazma içerisinde dağılmış haldedir.